单细胞基因组扩增有哪些好处
加入时间:2016-06-21 11:33:24 当前新闻点击率:2871
研究人员通常会在下游分析中遭遇DNA样本量有限或不足的问题。做为一种增加有限DNA量的方法,全基因组扩增技术于1992年出现,该方法特别适于法医学鉴定和遗传疾病的研究,以及如二代测序技术和CGH阵列(比较基因组杂交)等新技术应用,后者的主要难题就在于DNA样本数量有限,但分析需求量又很可观。单细胞基因组扩增优化了等温扩增的反应体系,可实现微量样本全基因组无差别扩增。 使用高度续进性的Phi29聚合酶得到的长DNA片段确保了Phi29扩增得到的DNA覆盖了整个基因组,连贯并且无偏地扩增所有遗传位点。在有偏的研究中,使用MDA、DOP–PCR和PEP技术对不同数量的基因组DNA进行扩增(0.3–300 ng)。使用定量检测real-time PCR确定8个遗传位点相对的表达量。通过与1 µg未扩增的对照DNA作比较,可以确定遗传位点的表达。由于未消除的二级结构会导致不同位点的不等同扩增,基于PCR的WGA方法(比如DOP–PCR或者PEP)经常会导致遗传位点丢失。MDA具有最好的DNA扩增覆盖效果,并且将遗传位点丢失的风险降到了最低。 普朗医疗生产的这款全基因组扩增(Whole Genome Amplification)是一种对全部基因组序列进行非选择性扩增的技术,其目的是在没有序列倾向性的前提下大幅度增加DNA的总量。采用MDA(多重链置换扩增)的方法,能够在16个小时之内,将ng甚至是pg级的微量DNA有效扩增至10-40μg高覆盖度的全基因组DNA。
(普朗医疗品牌----全基因组扩增试剂盒) 这款全基因组扩增试剂盒已经把扩增后的产物进行二代测序,覆盖度能达到90%以上,各条染色体基因组的偏差基本一致;同时,我们随机选取了10个SNP位点进行扩增,起始样本和扩增后的样本均有相应的特异性条带,基本没有差异。想了解更多的内容和资讯的话可以拨打免费电话:400-6656-888进行咨询。 相关阅读: 下一篇:
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